MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 plasmid pHALHY02

Total Repeats: 2442

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015512	GCG	2	6	402	407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661891
2	NC_015512	G	6	6	407	412	0 %	0 %	100 %	0 %	332661891
3	NC_015512	G	7	7	415	421	0 %	0 %	100 %	0 %	332661891
4	NC_015512	GGA	2	6	455	460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661891
5	NC_015512	G	7	7	479	485	0 %	0 %	100 %	0 %	332661891
6	NC_015512	T	8	8	491	498	0 %	100 %	0 %	0 %	332661891
7	NC_015512	GCA	2	6	747	752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661892
8	NC_015512	CGA	2	6	770	775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661892
9	NC_015512	CTC	2	6	798	803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661892
10	NC_015512	GAC	2	6	882	887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661892
11	NC_015512	CTA	3	9	893	901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661892
12	NC_015512	T	6	6	914	919	0 %	100 %	0 %	0 %	332661892
13	NC_015512	TGA	2	6	992	997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661892
14	NC_015512	GTG	2	6	1035	1040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661892
15	NC_015512	ACT	2	6	1108	1113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661892
16	NC_015512	GCA	2	6	1195	1200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661892
17	NC_015512	ACG	2	6	1231	1236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661892
18	NC_015512	TGC	2	6	1249	1254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661892
19	NC_015512	GAA	2	6	1383	1388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661892
20	NC_015512	TAA	2	6	1415	1420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332661892
21	NC_015512	GGT	2	6	1424	1429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661892
22	NC_015512	T	7	7	1496	1502	0 %	100 %	0 %	0 %	332661892
23	NC_015512	GCC	2	6	1551	1556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661892
24	NC_015512	TGC	2	6	1630	1635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661892
25	NC_015512	GAA	2	6	1704	1709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661892
26	NC_015512	CAG	2	6	1718	1723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661892
27	NC_015512	TTC	2	6	1868	1873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661893
28	NC_015512	TCA	2	6	1968	1973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661893
29	NC_015512	GTG	2	6	2018	2023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661893
30	NC_015512	ACCC	2	8	2053	2060	25 %	0 %	0 %	75 %	332661893
31	NC_015512	GGC	2	6	2113	2118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661893
32	NC_015512	T	6	6	2119	2124	0 %	100 %	0 %	0 %	332661893
33	NC_015512	CCAC	2	8	2141	2148	25 %	0 %	0 %	75 %	332661893
34	NC_015512	CAA	2	6	2156	2161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661893
35	NC_015512	CAAA	2	8	2170	2177	75 %	0 %	0 %	25 %	332661893
36	NC_015512	CAG	2	6	2183	2188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661893
37	NC_015512	AGC	2	6	2247	2252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661893
38	NC_015512	CTG	2	6	2279	2284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661893
39	NC_015512	TGC	2	6	2376	2381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661893
40	NC_015512	TGAG	2	8	2472	2479	25 %	25 %	50 %	0 %	332661893
41	NC_015512	GCGCAG	2	12	2480	2491	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	332661893
42	NC_015512	TGA	2	6	2571	2576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661893
43	NC_015512	GGC	2	6	2587	2592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661893
44	NC_015512	AGC	2	6	2600	2605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661893
45	NC_015512	GGA	2	6	2656	2661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661893
46	NC_015512	GCA	2	6	2704	2709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661893
47	NC_015512	GCAGA	2	10	2714	2723	40 %	0 %	40 %	20 %	332661893
48	NC_015512	CGA	2	6	2725	2730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661893
49	NC_015512	CTA	2	6	2743	2748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661893
50	NC_015512	TTG	2	6	2756	2761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661893
51	NC_015512	GAA	2	6	2807	2812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661893
52	NC_015512	CTG	2	6	2816	2821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661893
53	NC_015512	GCG	2	6	2848	2853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661893
54	NC_015512	GCT	2	6	2905	2910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661893
55	NC_015512	GCG	2	6	2938	2943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661893
56	NC_015512	G	6	6	2959	2964	0 %	0 %	100 %	0 %	332661893
57	NC_015512	AAGG	2	8	3025	3032	50 %	0 %	50 %	0 %	332661893
58	NC_015512	GGC	2	6	3069	3074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661893
59	NC_015512	TTG	2	6	3086	3091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661893
60	NC_015512	CTGGCG	2	12	3113	3124	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	332661893
61	NC_015512	GTG	2	6	3125	3130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661893
62	NC_015512	TGT	2	6	3141	3146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661893
63	NC_015512	ATG	2	6	3165	3170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661893
64	NC_015512	AAG	2	6	3255	3260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661893
65	NC_015512	ATA	2	6	3294	3299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332661893
66	NC_015512	AAC	2	6	3317	3322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661893
67	NC_015512	AGA	2	6	3333	3338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661893
68	NC_015512	AAC	2	6	3377	3382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661893
69	NC_015512	GCG	2	6	3404	3409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661893
70	NC_015512	A	6	6	3430	3435	100 %	0 %	0 %	0 %	332661893
71	NC_015512	AATA	2	8	3443	3450	75 %	25 %	0 %	0 %	332661893
72	NC_015512	A	7	7	3462	3468	100 %	0 %	0 %	0 %	332661894
73	NC_015512	T	7	7	3478	3484	0 %	100 %	0 %	0 %	332661894
74	NC_015512	GGGGA	2	10	3493	3502	20 %	0 %	80 %	0 %	332661894
75	NC_015512	GAT	2	6	3624	3629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661894
76	NC_015512	G	6	6	3709	3714	0 %	0 %	100 %	0 %	332661894
77	NC_015512	GCAG	2	8	3734	3741	25 %	0 %	50 %	25 %	332661894
78	NC_015512	AGCT	2	8	3772	3779	25 %	25 %	25 %	25 %	332661894
79	NC_015512	CAT	2	6	3800	3805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661894
80	NC_015512	ATT	2	6	3822	3827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661894
81	NC_015512	CCTAT	2	10	3884	3893	20 %	40 %	0 %	40 %	332661894
82	NC_015512	TGG	2	6	4000	4005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661894
83	NC_015512	CCCG	2	8	4029	4036	0 %	0 %	25 %	75 %	332661894
84	NC_015512	CAGC	2	8	4054	4061	25 %	0 %	25 %	50 %	332661894
85	NC_015512	TC	3	6	4099	4104	0 %	50 %	0 %	50 %	332661894
86	NC_015512	AAAC	2	8	4299	4306	75 %	0 %	0 %	25 %	332661894
87	NC_015512	CCTCAA	2	12	4307	4318	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	332661894
88	NC_015512	CTG	2	6	4327	4332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661894
89	NC_015512	CTG	2	6	4453	4458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661894
90	NC_015512	GAC	2	6	4512	4517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661894
91	NC_015512	AAAC	2	8	4551	4558	75 %	0 %	0 %	25 %	332661894
92	NC_015512	TGC	2	6	4577	4582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661894
93	NC_015512	AAAC	2	8	4677	4684	75 %	0 %	0 %	25 %	332661894
94	NC_015512	CTG	2	6	4705	4710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661894
95	NC_015512	CCG	2	6	4732	4737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661894
96	NC_015512	CAAA	2	8	4802	4809	75 %	0 %	0 %	25 %	332661894
97	NC_015512	AAAC	2	8	4929	4936	75 %	0 %	0 %	25 %	332661894
98	NC_015512	CCG	2	6	4960	4965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661894
99	NC_015512	GAC	2	6	5016	5021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661894
100	NC_015512	CAAA	2	8	5054	5061	75 %	0 %	0 %	25 %	332661894
101	NC_015512	GAC	2	6	5085	5090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661894
102	NC_015512	AAAC	2	8	5181	5188	75 %	0 %	0 %	25 %	332661894
103	NC_015512	GAC	2	6	5211	5216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661894
104	NC_015512	ACC	2	6	5274	5279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661894
105	NC_015512	AAAC	2	8	5307	5314	75 %	0 %	0 %	25 %	332661894
106	NC_015512	GGCT	2	8	5433	5440	0 %	25 %	50 %	25 %	332661894
107	NC_015512	ACT	2	6	5465	5470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661894
108	NC_015512	CTC	2	6	5517	5522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661894
109	NC_015512	GGC	2	6	5597	5602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661894
110	NC_015512	G	6	6	5612	5617	0 %	0 %	100 %	0 %	332661894
111	NC_015512	A	6	6	5631	5636	100 %	0 %	0 %	0 %	332661894
112	NC_015512	GCG	2	6	5676	5681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661894
113	NC_015512	GCT	2	6	5699	5704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661894
114	NC_015512	TGC	2	6	5728	5733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661894
115	NC_015512	GCG	2	6	5742	5747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661894
116	NC_015512	GAT	2	6	5757	5762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661894
117	NC_015512	GGAAG	2	10	5789	5798	40 %	0 %	60 %	0 %	332661894
118	NC_015512	AGG	2	6	5815	5820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661894
119	NC_015512	A	6	6	5916	5921	100 %	0 %	0 %	0 %	332661895
120	NC_015512	ATT	2	6	5924	5929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661895
121	NC_015512	T	6	6	5941	5946	0 %	100 %	0 %	0 %	332661895
122	NC_015512	GCA	2	6	5972	5977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661895
123	NC_015512	GAT	2	6	6075	6080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661895
124	NC_015512	G	8	8	6095	6102	0 %	0 %	100 %	0 %	332661895
125	NC_015512	GATAA	2	10	6117	6126	60 %	20 %	20 %	0 %	332661895
126	NC_015512	GCGG	2	8	6173	6180	0 %	0 %	75 %	25 %	332661895
127	NC_015512	AAAC	2	8	6214	6221	75 %	0 %	0 %	25 %	332661895
128	NC_015512	CCG	2	6	6242	6247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661895
129	NC_015512	AAG	2	6	6305	6310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661895
130	NC_015512	TGA	2	6	6650	6655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661895
131	NC_015512	AAAC	2	8	6690	6697	75 %	0 %	0 %	25 %	332661895
132	NC_015512	AAAC	2	8	6816	6823	75 %	0 %	0 %	25 %	332661895
133	NC_015512	TC	3	6	6868	6873	0 %	50 %	0 %	50 %	332661895
134	NC_015512	CCG	2	6	6973	6978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661895
135	NC_015512	TC	3	6	6994	6999	0 %	50 %	0 %	50 %	332661895
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263	NC_015512	GAT	2	6	13340	13345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661900
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392	NC_015512	TTG	2	6	19906	19911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661904
393	NC_015512	AGGG	2	8	19971	19978	25 %	0 %	75 %	0 %	332661904
394	NC_015512	TTC	2	6	19981	19986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661904
395	NC_015512	TGG	2	6	19997	20002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661904
396	NC_015512	CAGG	2	8	20180	20187	25 %	0 %	50 %	25 %	332661904
397	NC_015512	ATG	2	6	20191	20196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661904
398	NC_015512	GAT	2	6	20199	20204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661904
399	NC_015512	CCA	2	6	20240	20245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661904
400	NC_015512	TGC	2	6	20272	20277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661904
401	NC_015512	TGT	2	6	20405	20410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661904
402	NC_015512	TCGGCG	2	12	20706	20717	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	332661905
403	NC_015512	GAT	2	6	20756	20761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661905
404	NC_015512	TTTTGG	2	12	20769	20780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661905
405	NC_015512	GTGG	2	8	20873	20880	0 %	25 %	75 %	0 %	332661905
406	NC_015512	TGC	2	6	20886	20891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661905
407	NC_015512	TCC	2	6	20913	20918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661905
408	NC_015512	CAG	2	6	20990	20995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661905
409	NC_015512	GCG	2	6	21003	21008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661905
410	NC_015512	CCT	2	6	21019	21024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661905
411	NC_015512	CAA	2	6	21107	21112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661905
412	NC_015512	CAA	2	6	21179	21184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661905
413	NC_015512	TGG	2	6	21243	21248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661905
414	NC_015512	GCTG	2	8	21268	21275	0 %	25 %	50 %	25 %	332661905
415	NC_015512	TG	3	6	21315	21320	0 %	50 %	50 %	0 %	332661905
416	NC_015512	T	7	7	21326	21332	0 %	100 %	0 %	0 %	332661905
417	NC_015512	GCA	2	6	21346	21351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661905
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423	NC_015512	CCA	2	6	21847	21852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661906
424	NC_015512	TGC	2	6	21872	21877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661906
425	NC_015512	TTG	2	6	21892	21897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661906
426	NC_015512	GTA	2	6	22085	22090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661906
427	NC_015512	ATGA	2	8	22153	22160	50 %	25 %	25 %	0 %	332661906
428	NC_015512	CGG	2	6	22205	22210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661906
429	NC_015512	GAT	2	6	22224	22229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661906
430	NC_015512	TAGGG	2	10	22267	22276	20 %	20 %	60 %	0 %	332661906
431	NC_015512	CAA	2	6	22320	22325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661906
432	NC_015512	TCA	2	6	22372	22377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661906
433	NC_015512	TCAA	2	8	22435	22442	50 %	25 %	0 %	25 %	332661906
434	NC_015512	T	6	6	22446	22451	0 %	100 %	0 %	0 %	332661906
435	NC_015512	TGC	2	6	22556	22561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661906
436	NC_015512	GGC	2	6	22620	22625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661906
437	NC_015512	CCT	2	6	22832	22837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661906
438	NC_015512	GGC	2	6	22869	22874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661906
439	NC_015512	T	6	6	22887	22892	0 %	100 %	0 %	0 %	332661906
440	NC_015512	CTA	2	6	22924	22929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661906
441	NC_015512	TTC	2	6	22932	22937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661906
442	NC_015512	TGG	2	6	22993	22998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661906
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445	NC_015512	TTC	2	6	23071	23076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661906
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450	NC_015512	GTA	2	6	23292	23297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661906
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454	NC_015512	CGG	2	6	23525	23530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661906
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456	NC_015512	AG	3	6	23610	23615	50 %	0 %	50 %	0 %	332661906
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460	NC_015512	CAA	2	6	23733	23738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661906
461	NC_015512	ATC	2	6	23739	23744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661906
462	NC_015512	A	7	7	23773	23779	100 %	0 %	0 %	0 %	332661906
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464	NC_015512	TCC	2	6	24262	24267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661907
465	NC_015512	C	6	6	24299	24304	0 %	0 %	0 %	100 %	332661907
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471	NC_015512	GCG	2	6	24529	24534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661907
472	NC_015512	CAC	2	6	24551	24556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661907
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474	NC_015512	CTT	2	6	24567	24572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661907
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476	NC_015512	AGGT	2	8	24604	24611	25 %	25 %	50 %	0 %	332661907
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480	NC_015512	GCTG	2	8	24734	24741	0 %	25 %	50 %	25 %	332661907
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482	NC_015512	GCTGGC	2	12	24774	24785	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	332661907
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496	NC_015512	GTT	2	6	25192	25197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661907
497	NC_015512	T	6	6	25205	25210	0 %	100 %	0 %	0 %	332661907
498	NC_015512	A	6	6	25259	25264	100 %	0 %	0 %	0 %	332661907
499	NC_015512	ATT	2	6	25284	25289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661907
500	NC_015512	TAAA	2	8	25329	25336	75 %	25 %	0 %	0 %	332661907

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